220X год. Цивилизация шагнула далеко за грань привычного интернета — теперь весь мир оплетён невидимой «Волновой дорогой», сетью, где информация течёт быстрее света. В этом мире живёт Субару Хосикава, обычный пятиклассник, чья жизнь раскололась после трагедии: его отец исчез в космической катастрофе. Мальчик пытается жить дальше, но судьба готовит ему встречу, которая перевернёт всё.

С неба, с далёкой планеты FM, спускается загадочная внеземная радиоволна по имени Уор-Рок. Это существо заявляет, что знает правду об исчезновении отца Субару. Но тайна притягивает охотников: множество инопланетных созданий идут по следу Уор-Рока, готовых уничтожить любого, кто встанет на пути. Субару оказывается между двух огней — и выбирает не прятаться.

Объединившись с Уор-Роком, мальчик получает способность сливаться с ним в единую форму — Мегамена, радиоволнового воина, способного путешествовать по Волновой дороге и вступать в битвы с вирусами и FMS-монстрами, угрожающими Земле. Теперь каждый бой — не просто схватка, а гонка за истиной. Каждая атака приближает Субару не только к спасению мира, но и к разгадке секретов своего прошлого. Вопрос лишь в том, кто выживет первым: мальчик с мечтой или те, кто охотится за его силой.