Мир, где цифровые сети и усовершенствованные тела сплелись в единое целое, вновь сталкивается с угрозами, способными разрушить хрупкий баланс. Девятый отдел общественной безопасности, чьи оперативники были вынуждены покинуть службу, возвращается к работе. Их цель — противостоять лавине киберпреступлений, захлестнувшей мегаполисы, и разобраться в странной волне самоубийственных акций, которые совершают разрозненные группы, известные под именем «Индивидуальные одиннадцать».

Пока Мотоко Кусанаги и её команда пытаются распутать клубок заговоров, на горизонте сгущаются тучи. Поток беженцев, ищущих убежище в стране, становится детонатором для политического кризиса, который грозит перерасти в полномасштабную войну. Каждое расследование отдел ведёт на грани, ведь за каждым преступлением скрывается не просто хаос, а тщательно спланированная операция, где нити ведут к самым верхам власти.

Второй сезон культового аниме углубляет интригу, заставляя героев лавировать между долгом, правдой и собственными убеждениями. Технологии и человеческая природа сталкиваются в опасном танце, где любая ошибка может стоить не только жизни, но и будущего всего общества.