Этот фильм начинается с того момента, когда у Такато уже появляется его верный партнёр — дигимон Гилмон. Парень собирается провести каникулы в Окинаве и, конечно, прихватывает с собой цифрового друга. На курортном острове они случайно встречают ещё одного укротителя по имени Минами, и вместе они проводят время на пляже, наслаждаясь беззаботным отдыхом.

Но спокойная атмосфера рушится, когда по всей Японии начинается настоящий цифровой хаос: популярная виртуальная зверушка, которую держат у себя миллионы людей, неожиданно превращается в опасный вирус и заражает компьютеры один за другим. Такато пытается разобраться в причинах эпидемии, но тут его ждёт неприятный сюрприз — остальные дигимоны явно настроены к Гилмону враждебно. Теперь парню предстоит выяснить, не связан ли его собственный партнёр с этой катастрофой и что вообще происходит.